呼吸道核酸檢測標(biāo)本上呼吸道與下呼吸道的區(qū)別

本文來源微信公眾號圣檢E訊，原文標(biāo)題：呼吸道核酸檢測標(biāo)本選擇有門道，上呼吸道標(biāo)本能否“C 位”出道？

呼吸道感染標(biāo)本類型

呼吸道感染包括上呼吸道感染和下呼吸道感染。上呼吸道標(biāo)本易于采集，主要包括口咽拭子、鼻咽拭子、鼻咽吸取物，可用于咽炎、喉炎、扁桃體炎、鼻竇炎病原體的檢測。下呼吸道標(biāo)本包括痰液、氣管吸取物、支氣管肺泡灌洗液等，用于氣管支氣管炎、肺炎、肺膿腫等病原體的檢測，不同標(biāo)本類型的臨床應(yīng)用見下表。

上呼吸道標(biāo)本檢測下呼吸道感染的研究進(jìn)展

01口咽拭子檢測下呼吸道感染

• 題目：評估社區(qū)獲得性肺炎患者中口咽拭子作為替代下呼吸道樣本進(jìn)行PCR檢測的診斷效用

• IF：6.1

• 發(fā)表時(shí)間：2023年9月

• 文章要點(diǎn)：

  本研究使用PCR方法評估了到急診科就診的CAP（Community Acquired Pneumonia）患者的口咽拭子（Oropharyngeal swab，OPs）和下呼吸道（Lower respiratory tract，LRT）標(biāo)本之間微生物檢測的一致性。入組103例確診的CAP患者，分別取OPs和高質(zhì)量的LRT標(biāo)本。LRT標(biāo)本主要通過誘導(dǎo)痰獲得（88%）。以下呼吸道標(biāo)本為參考標(biāo)準(zhǔn)，口咽拭子對CAP最常見的細(xì)菌病原體肺炎鏈球菌和流感嗜血桿菌的陽性符合率（PPA）、陰性符合率（NPA）和總體符合率分別為85%、99%和95%；86%、98%和93%?？ㄋ腜PA較低（74%），而NPA為100%。對于不太可能引起無并發(fā)癥CAP的細(xì)菌（例如金黃色葡萄球菌和腸桿菌目細(xì)菌），結(jié)果差異較大?？傊cLRT標(biāo)本相比，OPs標(biāo)本對最常見的CAP病原體肺炎鏈球菌和流感嗜血桿菌檢測，具有較高的PPAs和NPAs。這提示使用PCR方法對口咽拭子進(jìn)行檢測是急診科患者快速病原體檢測的替代方法，特別是對于難以獲得LRT樣本的患者。

02鼻咽拭子檢測下呼吸道感染

• 題目：評估鼻咽拭子在呼吸道細(xì)菌感染引起的社區(qū)獲得性肺炎患者中進(jìn)行PCR檢測的診斷效果

• IF：3.7

• 發(fā)表時(shí)間：2022

• 文章要點(diǎn)：

  本研究入組了118例患者，評估用鼻咽（Nasopharyngeal swab，NPs）拭子檢測肺炎鏈球菌、流感嗜血桿菌和卡他莫拉菌的性能。以下呼吸道感染標(biāo)本為參考，鼻咽拭子對肺炎鏈球菌的陽性符合率（PPA）和陰性符合率（NPA）分別為58%和100%，流感嗜血桿菌的PPA和NPA分別為61%和100%，卡他莫拉菌的PPA和NPA分別為57%和99%。以標(biāo)準(zhǔn)診斷方法為參考，鼻咽拭子對肺炎鏈球菌的PPA和NPA分別為58%和96%，流感嗜血桿菌的PPA和NPA分別為74%和87%，卡他莫拉菌的NPA為92%。結(jié)果表明，鼻咽拭子識(shí)別下呼吸道感染最常見病因的PPA有限，無法用于停用抗生素，但其出色的NPA表明可利用鼻咽拭子PCR結(jié)果快速進(jìn)行針對性抗菌治療。

• 題目：重癥肺炎患兒上、下呼吸道病原菌鑒定的一致性

• IF：3.4

• 發(fā)表時(shí)間：2023

• 文章要點(diǎn)：

  本研究旨在比較兒童嚴(yán)重肺炎患者鼻咽拭子和支氣管肺泡灌洗液（BALF）在病原體檢出方面的一致性，探討鼻咽拭子采樣能否替代肺泡灌洗液用于兒童 CAP 的病因診斷。研究入組了153名兒童肺炎患者，研究結(jié)果發(fā)現(xiàn)鼻咽拭子與BALF中的肺炎支原體的一致性最高（Cohen’s kappa = 0.64），其次是流感嗜血桿菌（Cohen’s kappa = 0.47）。銅綠假單胞菌一致性最差，僅在BALF樣本中被檢出。

03鼻咽吸取物檢測下呼吸道感染

• 題目：鼻咽吸取物與肺部標(biāo)本在成人獲得性肺炎的分子診斷性能比較

• IF：4.0

• 發(fā)表時(shí)間：2018

• 文章要點(diǎn)：

  本研究納入103名成人患者，這些患者均患有社區(qū)獲得性肺炎（CAP）或慢性阻塞性肺病（COPD）急性加重。所有患者均在入院時(shí)同時(shí)收集了鼻咽抽吸物和下呼吸道樣本（包括誘導(dǎo)痰、氣管抽吸物或支氣管肺泡灌洗液）。使用多重分子檢測方法對樣本進(jìn)行檢測，該方法可同時(shí)定性檢測4種細(xì)菌和18種呼吸道病毒。鼻咽抽吸物和下呼吸道樣本在病毒檢測方面的靈敏度相當(dāng)，分別為82%和88.5%（p= 0.36）。在6例軍團(tuán)菌肺炎感染中，只有1例在鼻咽抽吸物中被檢測到（16%），而所有6例均在下呼吸道樣本中被檢測到，表明肺部樣本對軍團(tuán)菌肺炎的診斷效能明顯優(yōu)于鼻咽抽吸物。因此，肺部樣本和鼻咽抽吸物在多重PCR檢測呼吸道病毒方面的診斷靈敏度相似。然而，對于嗜肺軍團(tuán)菌的檢測，肺部樣本的診斷效能明顯優(yōu)于鼻咽抽吸物。

總結(jié)

在肺炎患者中，上呼吸道標(biāo)本可輔助或者替代下呼吸道標(biāo)本進(jìn)行病原體檢測，但需根據(jù)患者身體情況、病原體類型與臨床場景進(jìn)行選擇。例如在危急重癥或者兒童、老年人等難以獲得高質(zhì)量下呼吸道標(biāo)本的患者中，口咽拭子/鼻吸取物可以作為替代，檢測CAP常見的肺炎鏈球菌、流感嗜血桿菌或呼吸道病毒等，但需排除定植菌的干擾。

撰寫 | 許瑩碩

校稿 編審 | 劉娟

編輯 | 譚易秋子

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