DNA甲基化檢測室間質(zhì)評預(yù)研結(jié)果公布！

近日，國家臨檢中心首次對DNA甲基化檢測產(chǎn)品應(yīng)用開展的全國性室間質(zhì)量評價預(yù)研活動結(jié)果公布，測評涉及多家試劑廠商，信息量極大，詳情請見如下分析。

本次預(yù)研是國家衛(wèi)生健康委臨床檢驗中心首次對DNA甲基化檢測產(chǎn)品應(yīng)用進行系統(tǒng)性檢測，有利于各醫(yī)療機構(gòu)/實驗室更加了解各廠商DNA甲基化檢測產(chǎn)品性能指標(biāo)、進一步掌握甲基化檢測方法，并加速推動DNA甲基化檢測領(lǐng)域市場放量和發(fā)展。

DNA甲基化檢測臨床診療應(yīng)用受到高度肯定，首次納入國家臨檢中心室間質(zhì)量評價預(yù)研

DNA甲基化是最早被發(fā)現(xiàn)且研究最深入的表觀遺傳調(diào)控機制之一，指在DNA甲基化轉(zhuǎn)移酶的作用下，基因組CpG二核苷酸的胞嘧啶5號碳位共價鍵結(jié)合一個甲基基團。大量研究表明，DNA甲基化能引起染色質(zhì)結(jié)構(gòu)、DNA構(gòu)象、DNA穩(wěn)定性及DNA與蛋白質(zhì)相互作用方式的改變，從而控制基因表達，是早期癌癥和癌前病變的重要信號。

目前，DNA甲基化相關(guān)腫瘤標(biāo)志物被逐步應(yīng)用于臨床診療中。例如Septin9基因甲基化可以作為特定人群（如40歲以上，具有結(jié)直腸癌一般風(fēng)險，且其已被提供過但未能完成常規(guī)便隱血加腸鏡篩查的成年人，不分性別）篩查的標(biāo)志物，以及MGMT基因甲基化可以作為高級別腦膠質(zhì)瘤患者術(shù)后替莫唑胺化療的決策及預(yù)后評估的標(biāo)志物。此外，臨床用于DNA甲基化檢測的方法也較多，包括熒光PCR、PCR－基因芯片雜交、亞硫酸氫鹽測序以及高通量測序等。

DNA甲基化在腫瘤臨床診療的價值逐步得到認可：2022年5月，為了解我國各實驗室DNA甲基化相關(guān)腫瘤標(biāo)志物檢測能力的現(xiàn)狀，并為日后開展相關(guān)項目的室間質(zhì)量評價活動做準(zhǔn)備，國家衛(wèi)生健康委臨床檢驗中心首次對全國醫(yī)療機構(gòu)臨床實驗室開展DNA甲基化檢測室間質(zhì)量評價預(yù)研。其中，結(jié)直腸癌早篩早檢和腦膠質(zhì)瘤術(shù)后化療是國家癌癥防治首要錨定點，所以率先開展Septin9和MGMT基因甲基化檢測的室間質(zhì)量評價預(yù)研。其中，在Septin9基因甲基化檢測預(yù)研活動中，共計60家實驗室反饋有效的Septin9基因甲基化檢測質(zhì)評結(jié)果。

Septin9基因甲基化檢測室間質(zhì)量評價中，實驗室檢查合格率為96.67%

本次預(yù)研，共計60家實驗室反饋有效的Septin9基因甲基化檢測質(zhì)評結(jié)果，成績分布如下：100分的實驗室56家，90-99分（含90）的實驗室2家，60-90分（含60）的實驗室1家，低于60分（不含60）的實驗室1家。按照≥90分為合格的標(biāo)準(zhǔn)，合格率為96.67%（58/60）。

實驗室檢測方法以實時熒光PCR為主（59/60），另有1個實驗室采用靶向亞硫酸氫鹽測序（1/60）。作為第二代PCR技術(shù)，實時熒光定量PCR（qPCR）為當(dāng)前主流技術(shù)，該技術(shù)通過特異性熒光探針對指數(shù)期目的片段擴增熒光信號進行實時監(jiān)測，同時實現(xiàn)了絕對基因表達和相對定量檢測。

在DNA提取、亞硫酸鹽轉(zhuǎn)化、Bis-DNA純化、甲基化檢測等主要檢測環(huán)節(jié)，博爾誠、透景、為真等廠商為實驗室Septin9基因甲基化檢測提供核心檢測試劑。

檢測試劑整體表現(xiàn)優(yōu)異，博爾誠產(chǎn)品測試成績最為突出

60家實驗室中，56家（93.33%）實驗室檢出了所有的甲基化陽性樣本，其余4家實驗室報告了15個假陰性結(jié)果。各試劑廠商整體表現(xiàn)優(yōu)異，總體陽性符合率為97.22%，總體陰性符合率為100%。

本次預(yù)研共涉及12家廠商的基因甲基化檢測試劑產(chǎn)品，其中博爾誠、透鏡、為真等8家廠商產(chǎn)品性能優(yōu)異，陽性符合率和陰性符合率均為100%。

表1.各試劑檢測結(jié)果[1]

a7種商品化Septin9基因甲基化檢測試劑(實時熒光PCR法)；b4種實驗室自建的Septin9基因甲基化檢測試劑(實時熒光PCR法)；c1種Septin9基因甲基化檢測(靶向亞硫酸氫鹽測序法)

預(yù)研結(jié)果顯示，半數(shù)的實驗室（30/60）選擇博爾誠旗下產(chǎn)品思博定?Septin9基因甲基化檢測試劑盒，而且在檢測最多樣本的前提下，思博定?陽性符合率和陰性符合率均為100%，性能指標(biāo)優(yōu)秀且穩(wěn)定。

DNA甲基化檢測有望迎來規(guī)范化加速發(fā)展，各癌種DNA甲基化檢測產(chǎn)品將迎來市場放量

本次全國DNA甲基化檢測室間質(zhì)量評價預(yù)研傳遞出幾個信號：

一是DNA甲基化檢測在癌癥臨床診療中的價值受到國家高度認可，有望迎來規(guī)范化加速發(fā)展。國家衛(wèi)健委不僅開展了Septin9和MGMT基因甲基化檢測的室間質(zhì)量評價預(yù)研，又剛啟動了SDC2基因甲基化檢測的室間質(zhì)量評價預(yù)研。在癌癥診療方面，分子層面的DNA甲基化表觀遺傳檢測應(yīng)用愈發(fā)廣泛，經(jīng)過本次國家衛(wèi)健委預(yù)研后，預(yù)計關(guān)于DNA甲基化的關(guān)注和討論將逐漸增加，相關(guān)指南共識的出臺和DNA甲基化檢測技術(shù)路線的發(fā)展有望加速。

二是國家把結(jié)直腸癌等高發(fā)高危惡性腫瘤作為癌癥防治的重點。結(jié)直腸癌（CRC）是全球范圍內(nèi)的高發(fā)惡性腫瘤之一，在我國CRC發(fā)病率和死亡率分別居惡性腫瘤的第2和第5位[2]；腦膠質(zhì)瘤是由于大腦和脊髓膠質(zhì)細胞癌變所產(chǎn)生的、最常見的原發(fā)性顱腦腫瘤，預(yù)后通常較差。預(yù)研活動中，Septin9基因甲基化是結(jié)直腸癌篩查的標(biāo)志物，MGMT基因甲基化可以作為高級別腦膠質(zhì)瘤患者術(shù)后替莫唑胺化療的決策及預(yù)后評估的標(biāo)志物。

三是各癌種的DNA甲基化檢測產(chǎn)品將迎來市場放量。隨著國家衛(wèi)健委持續(xù)對各實驗室DNA甲基化相關(guān)腫瘤標(biāo)志物檢測能力進行測評，DNA甲基化檢測或?qū)⒊蔀槿夅t(yī)院臨檢中?評級必需項?。自新冠疫情以來。各級醫(yī)院逐步完成了PCR儀配備，PCR檢測平臺覆蓋率大幅提升。本次測評中各實驗室檢測準(zhǔn)確率均達到較高水平、甲基化檢測操作技術(shù)規(guī)范性很高，表明現(xiàn)階段我國DNA甲基化檢測平臺建設(shè)和檢測技術(shù)規(guī)范性都已趨近完善。與此同時，本次預(yù)研活動反映出Septin9基因甲基化作為結(jié)直腸癌早篩早檢標(biāo)志物已在臨床診療中被?泛應(yīng)用及肯定，以博爾誠為代表的表現(xiàn)優(yōu)異的廠商，其相同技術(shù)路線的消化道癌癥早篩早檢產(chǎn)品（如胃癌、?管癌等）進院的信任成本會大大降低，有望快速落地放量。

現(xiàn)階段基于PCR技術(shù)平臺的DNA甲基化檢測產(chǎn)品，將成為癌癥早篩早檢主力軍

現(xiàn)行癌癥篩查方法，按照檢測層級可以分為分子層面、細胞層面和組織層面。DNA包含最豐富的遺傳信息，是分子層面首選檢測對象，其中以DNA甲基化檢測為代表的表觀遺傳學(xué)檢測正逐步成為癌癥早篩早檢的主流技術(shù)路線。DNA甲基化異常出現(xiàn)時間早、容易通過ctDNA進行檢測，對于乳腺癌、結(jié)直腸癌等癌種，DNA甲基化異?？赡茉缬诨蛲蛔?，是檢測早期癌癥或癌前病變的良好指征；而且DNA甲基化通常具有更高的組織和癌癥類型特異性，不同部位癌癥的甲基化位點特征也不同。

以基于PCR平臺的血液Septin9基因甲基化檢測為例，憑借著早期、精準(zhǔn)、安全、方便等優(yōu)點，在臨床中應(yīng)用愈發(fā)廣泛。該檢測僅需10ml外周血、采樣便利、患者依從性好；對早期結(jié)直腸癌癥檢測靈敏度高，可達傳統(tǒng)腫瘤標(biāo)志物的5-10倍，極大地提高了早期癌癥檢出率；同時，PCR技術(shù)平臺因其高性價比和相對優(yōu)異的性能備受市場青睞，不僅適合于單個癌癥和多種癌癥聯(lián)合早檢，還可以進行療效觀察和復(fù)發(fā)監(jiān)測。

應(yīng)對癌癥的優(yōu)先級永遠是預(yù)防大于治療，如果能夠早診早治，大部分癌種通常并不致命。伴隨著科技的發(fā)展和各類檢測技術(shù)的不斷進步，以及人民健康意識的不斷提升，DNA甲基化等創(chuàng)新早檢手段的滲透率有望持續(xù)提高，幫助更多受檢者及早了解自身健康狀況，推動癌癥防治關(guān)口前移，共同攻克癌癥這個世界性難題。

數(shù)據(jù)來源：

[1]國家衛(wèi)生健康委臨床檢驗中心,全國Septin9基因甲基化檢測室間質(zhì)量評價預(yù)研結(jié)果報告,2022.12.

[2]世界衛(wèi)生組織國際癌癥研究機構(gòu)（IARC）GLOBOCAN2020數(shù)據(jù).