來(lái)源:檢驗(yàn)科學(xué) 閱讀量:次發(fā)表時(shí)間:2024-05-13 08:38:20
唾液作為一種分子診斷檢測(cè)樣本類型,對(duì)于SARS-CoV-2以外的傳染病,如猴痘和流感,展現(xiàn)出了巨大潛力。
這一研究結(jié)果在本周舉行的歐洲臨床微生物學(xué)和傳染病學(xué)會(huì)全球大會(huì)(ESCMID Global)上提出。
此外,在一次專家見(jiàn)面會(huì)上,研究人員主張加強(qiáng)對(duì)唾液在傳染病診斷中的探索和使用,他們指出,與更成熟的方法相比,唾液作為大規(guī)模篩查和世界資源有限地區(qū)的樣本類型的潛力,要大于其被感知的缺點(diǎn)——例如較低的靈敏度和樣本處理及運(yùn)輸問(wèn)題。
在ESCMID Global的海報(bào)展示中,由耶魯大學(xué)全球健康研究所的流行病學(xué)研究科學(xué)家兼教員Anne Wyllie領(lǐng)導(dǎo)的研究人員,展示了對(duì)30個(gè)來(lái)自猴痘陽(yáng)性個(gè)體的唾液樣本進(jìn)行測(cè)試的結(jié)果——該研究去年也發(fā)表【1】在MedRxiv上。
Wyllie因之前對(duì)SalivaDirect COVID-19測(cè)試的開(kāi)發(fā)做出貢獻(xiàn)而聞名,這是最早獲得美國(guó)食品藥品監(jiān)督管理局(FDA)緊急使用授權(quán)(EUA)的基于唾液的COVID-19測(cè)定之一。
在他們的研究中,Wyllie和同事們從Flow Health收集了Spectrum SDNA-100收集裝置中的樣本,并用五種不同的PCR測(cè)定進(jìn)行了測(cè)試。
他們還檢查了在各種模擬運(yùn)輸和儲(chǔ)存條件下樣本的穩(wěn)定性。
正如他們?cè)诤?bào)中解釋的,猴痘的當(dāng)前臨床診斷使用病變拭子,但許多患者在病變發(fā)作前就出現(xiàn)了癥狀。
作為美國(guó)疾病控制與預(yù)防中心認(rèn)可的傳播源,唾液可能有助于早期感染檢測(cè),以便快速進(jìn)行接觸后疫苗接種和隔離。
他們發(fā)現(xiàn),由美國(guó)公司Co-Diagnostics開(kāi)發(fā)的Logix Smart Mpox (2-Gene) RUO測(cè)定法,針對(duì)病毒F8L基因,整體檢測(cè)性能更好,在所有測(cè)定類型中平均循環(huán)閾值(Ct)值一致。
此外,唾液中猴痘病毒的檢測(cè)在三種不同的無(wú)提取工作流程中具有可比性,并且在多種條件下,DNA在原始唾液中相對(duì)穩(wěn)定,可持續(xù)24至48小時(shí),而在72小時(shí)時(shí)顯著降解。
他們得出結(jié)論,他們的研究結(jié)果支持使用唾液樣本可靠地診斷猴痘樣本,降低測(cè)試成本,并在中低收入國(guó)家實(shí)現(xiàn)更簡(jiǎn)單、更便宜的自我收集和測(cè)試。
同時(shí),內(nèi)布拉斯加大學(xué)醫(yī)學(xué)中心(UNMC)的研究人員展示了一項(xiàng)研究的結(jié)果,該研究檢查了自收集唾液樣本和無(wú)提取PCR在流感監(jiān)測(cè)中的效用,這是基于之前發(fā)表在2021年JAMA Network Open上的一些相同研究人員的研究【2】,后者評(píng)估了一個(gè)公立學(xué)校區(qū)的SARS-CoV-2篩查和環(huán)境監(jiān)測(cè)。
他們從急診科評(píng)估呼吸道疾病的73名患者中收集唾液,作為被動(dòng)滴漏,比較使用鼻咽(NP)拭子進(jìn)行商業(yè)多重分子板測(cè)試的臨床呼吸病原體測(cè)試的流感檢測(cè)。
他們還對(duì)2022年11月至2023年3月針對(duì)無(wú)癥狀個(gè)體的社區(qū)基礎(chǔ)監(jiān)測(cè)項(xiàng)目中剩余的自收集唾液樣本進(jìn)行了無(wú)提取測(cè)試。
UNMC研究人員發(fā)現(xiàn),使用提取自由RT-qPCR在滴漏樣本中隨時(shí)間檢測(cè)流感,與NP參考測(cè)試的一致性達(dá)到100%,其中有5名陽(yáng)性和68名陰性患者。
此外,研究人員發(fā)現(xiàn),社區(qū)基礎(chǔ)監(jiān)測(cè)項(xiàng)目的月陽(yáng)性率從零到近3%不等。
改變觀念
在COVID-19大流行期間,唾液作為一種傳染病分子診斷(MDx)測(cè)試的樣本類型取得了進(jìn)展,但尚未提升為與鼻咽拭子PCR測(cè)試的黃金標(biāo)準(zhǔn)相提并論。
在專家見(jiàn)面會(huì)上,Wyllie與利物浦熱帶醫(yī)學(xué)院的博士后研究員Rachel Louise Byrne一起,她也曾廣泛研究唾液作為SARS-CoV-2檢測(cè)的NP拭子的替代樣本類型。
Wyllie和Byrne指出了來(lái)自不同利益相關(guān)者的唾液樣本的常見(jiàn)感知問(wèn)題。
臨床醫(yī)生經(jīng)常引用性能較差、臨床價(jià)值有限、保險(xiǎn)報(bào)銷問(wèn)題以及改變醫(yī)生常規(guī)的困難。
與此同時(shí),臨床實(shí)驗(yàn)室經(jīng)常抱怨運(yùn)輸問(wèn)題、難以處理的樣本、低靈敏度和特異性以及有限的市場(chǎng)價(jià)值。
盡管如此,自2021年以來(lái),基于唾液的診斷市場(chǎng)在傳染病應(yīng)用方面的增長(zhǎng)速度,比內(nèi)分泌學(xué)、心臟病學(xué)、自身免疫測(cè)試和腫瘤學(xué)等其他幾個(gè)醫(yī)學(xué)測(cè)試類別要快,預(yù)計(jì)到2026年將保持近8%的復(fù)合年增長(zhǎng)率,Wyllie指出,引用了研究咨詢公司PreScouter的微生物學(xué)技術(shù)總監(jiān)Maikel Boot提供的數(shù)據(jù)。
“進(jìn)入唾液領(lǐng)域的時(shí)機(jī)已經(jīng)成熟,”Wyllie說(shuō)。
此外,Wyllie和Byrne認(rèn)為,唾液檢測(cè)的潛在優(yōu)勢(shì)值得打破圍繞它的一些先入之見(jiàn)。
它非常適合大規(guī)模和重復(fù)測(cè)試,而且不需要醫(yī)療保健工作者進(jìn)行收集,從而降低了傳播風(fēng)險(xiǎn)。
此外,盡管NP拭子相對(duì)無(wú)創(chuàng),但很明顯,向管子里滴口水是一種更舒適的收集程序。
此外,越來(lái)越多的研究挑戰(zhàn)了圍繞唾液檢測(cè)的許多負(fù)面看法。
Wyllie是2020年4月在MedRxiv上發(fā)表的一篇開(kāi)創(chuàng)性論文【3】的通訊作者,該論文證明了唾液對(duì)SARS-CoV-2檢測(cè)比NP拭子更敏感,該工作后來(lái)在當(dāng)年晚些時(shí)候發(fā)表在《新英格蘭醫(yī)學(xué)雜志》的通信【4】中進(jìn)行了總結(jié)。
與此同時(shí),Byrne是2023年1月在PLOS One上發(fā)表的一篇論文【5】的共同通訊作者,該論文展示了如何成功利用唾液采樣進(jìn)行醫(yī)療保健工作者的常規(guī)篩查。
她還是一位研究信函【6】的第一作者,該信函于2020年11月發(fā)表在《新發(fā)傳染病》上,顯示了110名患者唾液樣本中SARS-CoV-2病毒載量與鼻咽拭子樣本中發(fā)現(xiàn)的病毒載量相似。
還有許多其他同行評(píng)審出版物展示了唾液在SARS-CoV-2和其他呼吸道病毒(包括呼吸道合胞病毒、人副流感病毒、人偏肺病毒、人鼻病毒、流感和腺病毒)MDx測(cè)試中的潛力。
歐盟監(jiān)管機(jī)構(gòu)已經(jīng)跟進(jìn)了這些文獻(xiàn),為羅氏、Becton Dickinson/CerTest Biotec和Canary Molecular等公司的基于唾液的COVID-19診斷測(cè)試應(yīng)用了CE-IVD標(biāo)記。
然而,F(xiàn)DA仍然有些不信服,已經(jīng)向幾種基于唾液的診斷授予了EUA,但迄今為止尚未對(duì)任何基于唾液的測(cè)試授予完全許可——盡管目前尚不清楚提交了多少申請(qǐng)。
Wyllie和Byrne在ESCMID上指出,在醫(yī)療保健社區(qū)已經(jīng)習(xí)慣于使用NP拭子的情況下,進(jìn)行基于唾液的分子測(cè)試存在困難。
例如,Wyllie指出,使用唾液的測(cè)試必須專門為唾液設(shè)計(jì)——換句話說(shuō),使用與NP拭子相同的協(xié)議可能會(huì)損害基于唾液的測(cè)試性能。
此外,一致地收集質(zhì)量良好的唾液樣本可能更加困難,這對(duì)于測(cè)試性能至關(guān)重要。
如果使用正確的技術(shù),NP拭子通常是一致的,但唾液樣本可能會(huì)因患者提供樣本的指示方式而大不相同——更喜歡被動(dòng)滴漏而不是“吐痰”。
“良好的唾液樣本對(duì)良好的測(cè)試至關(guān)重要。”,Byrne說(shuō),“樣本應(yīng)該是清澈到白色的顏色。有時(shí)它會(huì)含有痰,例如,當(dāng)沒(méi)有給出清晰的指示時(shí),可能會(huì)發(fā)生這種情況。對(duì)于住院患者來(lái)說(shuō),收集樣本可能很困難,因?yàn)樗麄兛赡苁歉稍锖兔撍?。但?duì)于門診患者來(lái)說(shuō),它可以是一個(gè)非常有前景的樣本類型?!?/p>
這是Wyllie和同事們?cè)?020年與耶魯大學(xué)SalivaDirect團(tuán)隊(duì)合作評(píng)估該測(cè)試作為COVID-19監(jiān)測(cè)工具的使用時(shí),從NBA收集樣本時(shí)艱難學(xué)到的。
“NBA樣本是彩虹的每一種顏色?!?,她說(shuō)。
令人驚訝的是,他們發(fā)現(xiàn)最近攝入的食物和飲料對(duì)結(jié)果影響不大。
粘液和白細(xì)胞——即粘液——以及奇怪地,高濃度的高露潔牙膏是唯一始終混淆結(jié)果的東西。
唾液檢測(cè)可能已經(jīng)得到了公眾輿論的支持。
消費(fèi)者已經(jīng)習(xí)慣了所謂的“唾液套件”,這是多年來(lái)由23andMe等消費(fèi)者基因組學(xué)公司提供的,而在12月,SalivaDirect團(tuán)隊(duì)在MedRxiv上發(fā)表了一項(xiàng)調(diào)查結(jié)果【7】,表明如果他們能夠確保所有樣本類型對(duì)SARS-CoV-2測(cè)試的性能相等,消費(fèi)者壓倒性地更愿意選擇唾液作為樣本類型。
Wyllie承認(rèn):“但我們知道并非每個(gè)人都會(huì)接受它——向管子里滴口水不太有尊嚴(yán),而且有些藥物會(huì)導(dǎo)致口干,特別是在老年人口中。”
“我們需要考慮它可以促進(jìn)快速和容易測(cè)試的情景。至少我們需要將其驗(yàn)證為另一種工具,當(dāng)NP拭子有問(wèn)題時(shí),或者,例如,當(dāng)患者不想這樣做時(shí),就像一些父母對(duì)他們的孩子進(jìn)行RSV測(cè)試時(shí)看到的那樣?!?/p>
鑒于其在資源有限的環(huán)境中作為樣本類型的潛力,“我禁不住想到結(jié)核病,”Byrne說(shuō),他引用了2023年9月在《柳葉刀微生物》上發(fā)表的一篇綜述【8】,該綜述討論了多種替代樣本類型(包括唾液)與痰液進(jìn)行培養(yǎng)和核酸擴(kuò)增測(cè)試的準(zhǔn)確性。
盡管關(guān)于唾液樣本的數(shù)據(jù)有限,但口腔拭子已被證明是作為替代樣本類型的有前景的選擇,而且“如果你正在進(jìn)行口腔拭子,你基本上是在收集唾液,希望在未來(lái)幾年我們會(huì)看到更多的數(shù)據(jù)?!?/p>
參考文獻(xiàn)
[1] https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.06.12.23291295v1
[2] https://jamanetwork.com/journals/jamanetworkopen/fullarticle/2784428
[3] https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.04.16.20067835v1
[4] https://www.nejm.org/doi/10.1056/NEJMc2016359
[5] https://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0280908
[6] https://wwwnc.cdc.gov/eid/article/26/11/20-3283_article
[7] https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.12.13.23299858v1
[8] https://www.thelancet.com/journals/lanmic/article/PIIS2666-5247(23)00190-8/fulltext