尿液DNA一些常見問題解答

如何防止尿液DNA降解

尿液中的DNA降解速度很快,這成為其在個體識別中的應(yīng)用的障礙。我們?nèi)绾畏乐鼓蛞篋NA降解,提高其在法醫(yī)中的應(yīng)用價值?

尿液中含有哪些促進DNA降解的物質(zhì)

尿液中含有尿素、尿酸、肌酸、礦物鹽、激肽酶等多種物質(zhì),這些物質(zhì)會促進DNA的降解。尿液中的細(xì)菌也會分解DNA。此外,尿液中的PCR抑制因子如β-人絨毛膜促性腺激素也會降低DNA提取效率。

降低溫度能防止DNA降解嗎?

多數(shù)研究采用低溫保存尿液樣本,以防止DNA降解。但是,低溫也會使尿液中的結(jié)晶體沉淀,形成沙狀物,這些沉淀物會干擾DNA的提取。因此,僅僅降溫?zé)o法完全防止DNA的降解。

添加UTI抑制酶能提高DNA穩(wěn)定性嗎?

UTI(尿激酶抑制劑)是一種特異性抑制胰腺酶的藥物,可用來防治胰腺炎等疾病。研究表明,在尿液樣本中添加UTI,可以抑制蛋白酶對DNA的降解,從而提高DNA的穩(wěn)定性。適量的UTI可使尿液中的DNA保持可檢測狀態(tài)更長時間。

Tris-EDTA能夠提高DNA提取嗎?

尿液中的Tris-EDTA可通過螯合鈣、鎂等陽離子,起到抗鈣化的作用,減少尿酸鹽和氧化鈣的沉淀,避免其對DNA提取的干擾。此外,Tris-EDTA還可增加尿液pH值,抑制在酸性條件下形成的尿酸結(jié)晶。因此,適量的Tris-EDTA也可提高DNA的提取效率。

小批量處理是否也有利于DNA提取?

大量的尿液樣本中含有更多的鹽分,這會干擾DNA從尿液中提取出來。研究表明,將樣本分為小批量處理,然后再匯聚DNA提取,可以提高DNA回收率,獲得更完整的微生物組信息。

綜上,為提高尿液DNA穩(wěn)定性,可在樣品收集后及時加入適量UTI,然后低溫保存;提取DNA時將樣本分割小批量處理,避免過量鹽分的干擾,從而提高尿液中DNA的提取效率。這對于進一步開展尿液個體識別研究具有重要意義。

參考文獻

1. Suhua Zhang, Shumin Zhao, Ruxin Zhu, Gong Zhang, Chengtao Li, [UTI preventing DNA degradation of storing urinary samples for genotyping](https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S1875176811000023), Forensic Science International: Genetics Supplement Series, Volume 3, Issue 1, 2011

2. Ackerman AL, Anger JT, Khalique MU, Ackerman JE, Tang J, Kim J, Underhill DM, Freeman MR; NIH Multidisciplinary Approach to the Study of Chronic Pelvic Pain (MAPP). [Optimization of DNA extraction from human urinary samples for mycobiome community profiling.](https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6483181/) PLoS One. 2019 Apr 25;14(4):e0210306. doi: 10.1371/journal.pone.0210306. PMID: 31022216; PMCID: PMC6483181.

3. Munch MM, Chambers LC, Manhart LE, Domogala D, Lopez A, Fredricks DN, Srinivasan S. [Optimizing bacterial DNA extraction in urine.](https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6759279/) PLoS One. 2019 Sep 24;14(9):e0222962. doi: 10.1371/journal.pone.0222962. PMID: 31550285; PMCID: PMC6759279.

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