糞便拭子與直腸拭子可以互相替代么

直腸拭子和糞便拭子采集樣本是分析腸道微生物群的兩種常見方法。糞便拭子采集的糞便樣本被認(rèn)為是腸道微生物群的代表，而直腸拭子則被認(rèn)為能捕捉到腸道和粘膜群落的組合。然而，直腸拭子能很好地替代糞便樣本嗎？

直腸拭子和糞便樣本的微生物組成有何不同？

2021 年的一項(xiàng)研究顯示，直腸拭子和糞便之間的微生物組成存在差異，拭子顯示出更高的α多樣性。與粘膜樣本相比，拭子樣本的分類學(xué)特征各不相同，但更為相似。拭子中富含某些菌屬，如丙酸桿菌和普雷沃特氏菌，而糞便中則含有較多的甲烷桿菌。總的來說，拭子似乎能捕捉到管腔微生物和粘膜微生物的混合物。

直腸拭子和糞便樣本中微生物組數(shù)據(jù)的一致性如何？

在分析微生物組與 BMI 和抗生素使用等宿主因素之間的關(guān)聯(lián)時(shí)，糞便和直腸拭子之間的結(jié)果高度一致。這表明直腸拭子可以作為糞便的合理替代物，尤其是在糞便采集困難的情況下。但在某些情況下，直腸拭子并不能完全再現(xiàn)糞便微生物群。

直腸拭子能否取代粘膜活檢？

粘膜樣本在分類和功能上都有別于管腔糞便和拭子。此外，粘膜樣本和其他樣本與宿主因素的關(guān)聯(lián)也各不相同。因此，直腸拭子不能完全替代粘膜活檢來研究腸道粘膜相關(guān)微生物。

因此，直腸拭子提供的微生物組圖譜在分類和途徑方面與糞便樣本相對(duì)一致。因此，當(dāng)糞便采集不可行時(shí)，直腸拭子有可能代替糞便。然而，拭子并不能復(fù)制糞便或粘膜樣本的所有方面。生物樣本的選擇會(huì)影響研究結(jié)果。

參考文獻(xiàn)

Sun S, Zhu X, Huang X, Murff HJ, Ness RM, Seidner DL, Sorgen AA, Blakley IC, Yu C, Dai Q, Azcarate-Peril MA, Shrubsole MJ, Fodor AA. On the robustness of inference of association with the gut microbiota in stool, rectal swab and mucosal tissue samples. Sci Rep. 2021 Jul 21;11(1):14828. doi: 10.1038/s41598-021-94205-5. PMID: 34290321; PMCID: PMC8295290.

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